安溪吴氏源远流长，历代编修的家谱、宗谱、族谱等保存着珍贵的家族史料，但以明清以后居多。
1. 《岭后吴氏族谱》
长坑三村吴氏族谱。现存为清光绪年间(1875～1908年)编修本与民国35年(1946年)编修本。其旧谱的字行为：
毓秀盛元宗，子孙克绍隆。丰功伟烈大，祖德永享扬。
固业开基广，仲恩垂裕长。云礽高隽发，奕世启文章。
民国35年(1946年)，订立全族的讳、字行，从三十五世起启用：
讳行：钦汝材照圻，金淮植燿坤，铨渊桂灼圭。
字行：坊钢源椿熙，墉钧清椒煴，基钊济松煇。
2. 《上第吴氏族谱》
祥华乡祥地村吴氏族谱，始修于明，清光绪三十四年(1908年)、民国35年(1946年)先后重修，其昭穆如下：
三世起讳行：江奇宇增锡，添懋耿城铭，澄杨炜墀钦，汝材照圻金，淮植燿坤铨，渊桂灼圭。
一世起字行：宦怀东畿曰乃，子钟淑本烈，培鋐衍树勋，坊钢源椿熙，墉钧清椒煴，基钊济松煇。
十一世起号行：万世派昌盛，百代衍流芳，诗书绳祖德，礼仪昭宗功。
3. 《金谷吴氏族谱》
明天启元年(1621年)由吴道轩、吴心弁始修。清乾隆四十八年(1783年)续修。咸丰十年
(1860年)三修，主要参加者为吴焕章、吴允嵩。光绪二十八年(1902年)由吴逢昌、吴宗岱主持四修。
八世起讳行：开景承延，文章华国，诗礼传家，立志奋为，名振朝班。
九世起字行：公侯伯子男，君卿大夫士，丕谟钦厚烈，佑启我苗昆。
4. 《谷山吴氏族谱》
蓬莱镇福山村吴氏族谱，始修于清乾隆三十九年(1774年)。乾隆五十四年(1789年)重修，仅有一本，约1.5万字。其字行为：
宾奕钟鼎，开耿承延，居仁由义，孝友睦姻，敬循懿训，世泽连绵，贞元旋转，裕后光前。
5. 《蓬星延寿院吴氏族谱》
始修于清乾隆二十九年(1764年)，乾隆五十四年(1789年)、嘉庆九年(1804年)、道光十二年(1832年)、同治九年(1870年)、民国5年(1916年)五次续修。
字行为：建文开仕第，立礼兆祯祥。祖德光明远，孙谋翼燕长。
6. 《龙涓后田吴氏谱牒》
始修不详，明嘉靖二十二年(1543年)续修，清光绪三十四年(1908年)、民国36年(1947年)两次再修。
字行：朱伯文克土锡，诗书立世端。
7. 《延陵厚山吴氏族谱》
龙涓乡石塔村吴氏族谱。始修于清乾隆二十三年(1758年)，由十二世孙吴显瑞作序。
讳行：孟仲叔孙季，运亨登国选。
字行：公侯伯子男，文炳振家声。
8. 《磐山吴氏族谱》
感德镇潘田村吴氏族谱。历史上曾多次编修，现存为1996年修纂本。昭穆：
内祖字行前五字为：维天敦培锡。
外祖字行前五字为：善仁丕培锡。
二十一世起字辈统一为：清树炳基遐，开派源流远，盛时颂瓞瓜。
9. 《感德石门吴氏族谱》
首修于明万历年间(1573～1619年)，后三十年为一修，1995年再次续修。自十一世起讳行为：
祖宗世承，克振家声，文明日兴，光大朝廷，子孙茂盛，麟凤瑞徵。
石门通族字行原为：源棨火 鼎在，锺淳懋 火 享。培锡清树，炳基钜浩。
自十六世起重编昭穆：
字行：维天敦培锡，清树炳基遐，开派源流远，盛时颂瓞瓜。
讳行：克振家声，文明日兴，光大朝廷，子孙茂盛，麟凤瑞徵。
号行：亭，圃国园囿囗于，江淮河汉满。佳作仁似仙，珍珠珀琅。
10. 《感德龙通吴氏族谱》
清道光、光绪年间各修纂一次，最近一次修于1997年。其讳行为：
祖宗世承，克振家声，文明日兴，光大朝廷，子孙茂盛，麟凤瑞徵。
11. 《凤城魁田吴氏族谱》
历代编修数次，现存为清宣统三年(1911年)编撰本，自八世起昭穆：
讳行：鸣钟洪懋焞，墀名淑植耀，培锡沃机炯。增鋐滋本焻，坚钰淯桢炜，基锟润柏煇。
字行：宪廷允式克，肇衍世侯卿，孝友成家道，子孙继泽长，济时饶俊彦，华国焕新章。
12. 《尚卿福林吴氏族谱》
历朝均有编修，现无存。字辈为：
积建文中新，兆为国家瑞。公侯伯子男，卿夫奕世贵，
智仁信义礼，孝友兼睦渊，传芳有盖宝，日启自多贤。
13. 《新田坪吴氏族谱》
感德尾厝吴氏族谱。编修于民国31年(1942年)。自二世起昭穆为：
简斯而泽，克振家声，文明日兴，元善安敦，本为秉性，懋昭大德，永裕长贻。
14. 《墩坂吴氏族谱》
历朝多次与南安仑苍吴氏合修谱牒，最近一次编修于2003年。自吴启衷开基南安仑苍始字行：
启斋圣秉钦，于德景宗伯。
后世再以七言为律编写昭穆，具体如下：
榜名行：欣兹国运逢隆日，心慕云鹏崇笃实，涵养文章博雅时，联翩直上真超轶。
字 行：天子卿如侯爵位，禄丰职重名嘉瑞，分标等列任飞升，得志称为经济器。
考 号：自仕南崖潮海居，诒谋燕翼秩宗舒，箕裘克绍来程远，昭穆双清庆有余。
讳 行：世光祖武永传芳，基业敬承信彦通，惟冀孙曾敦道学，朝廷应举显明堂。
妣 行：安贞柔正德诚良，恬静温和性善藏，淑慎端庄容妙美，琼芝萱草兆呈祥。
女讳行：石韫渊怀宝俟开，青莹皎洁本胚胎，既全覆载钟英质，好贮瑶宫鉴化栽。
15. 《泉山吴氏家谱》
湖头前山吴氏族谱，清道光元年(1821年)修纂，自十世起字行为：
邦国文章重，卿侯礼乐华，宣尔子孙懋，永念孝思佳。
16. 《厚安吴氏族谱》
剑斗吴氏族谱。始修于明嘉靖三十五年(1556年)，崇祯三年(1630年)、清康熙二十一年
(1682年)、乾隆四年(1739年)、同治七年(1868年)、民国元年(1912年)、民国32年(1943年)六次续修。1993年八修，共38卷。
其昭穆一至五世为：文仁义礼新。
六世起续编昭穆为：
讳行：承先要道忠和孝，启后良图读与耕。剑水文明欣大振，厚安德业卷长兴。
字行：时学如夫元若献，卿公侯辅世为家。田畴庭宇皆盈泰，顺则近光晋紫霞。
17. 《金山吴氏族谱》
凤城东门外吴氏族谱。历史上共修纂六次，前五次均与晋江龟湖后垵祖地宗亲合修。明嘉靖二十七年(1548年)首修，万历三十六年(1608年)、清顺治十七年(1660年)、乾隆十年(1745年)、嘉庆十七年(1812年)、光绪七年(1881年)五次续修。
讳行：尚绳皇祖武，道义必恭遵，得遂青云志，荣华显子孙，笃睦垂其训，敦源绍乃曾。
字行：懋学朝天子，士彦为公卿，孝友宗世德，文章振家声，诗书应继起，谋烈显丕承。
18. 《延陵黄龙族安溪荣安堂吴氏族谱》
凤城南街荣安堂吴氏族谱。编修于1997年，为该支派首次系统编纂，自十二世起字行沿用泉州黄龙通族64字行：
洪维我宗，生民自周，记序世家，端为之首，至德所贻，实庶且永，
代钟哲人，在君左右，允文亦武，亮节高风，辉煌典策，蔚焉国桢，
丕嗣徽音，望诸贤裔，凡亿孙曾，尚其懋哉。
19. 《金谷山门吴氏族谱》
编纂情况不明。昭穆：
讳行：继仸宗法公永文学兴元志朝诒茂燕美恢复祖武振传荣名
四世起字行：弘志试雅其奕代相承克绍芳声新建鸿基长发呈祥
